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1.机械清除法:主要是通过清扫、洗刷、通风、过滤等机械方法清除病原体。此法虽说普通而又常用，但达不到彻底消毒的目的，作为一种辅助方法，须与其他消毒方法配合进行。
2.物理消毒法:采用阳光、紫外线、干燥、高温、蒸煮等方法，杀灭细菌和病毒。
3.化学消毒法:用化学药物杀灭病原体是最为常用的方法。选用消毒药物应考虑杀菌广谱，有效浓度低，作用快，效果好;二是对人畜无害;三是性质稳定，易溶于水，不易受有机物和其他理化因素影响;四是使用方便，价廉，易于推广;五是无味，无臭，不损坏被消毒物品;六是使用后残留量少或副作用小等。
4.生物消毒法:常用该法将被污染的粪便堆积发酵，利用嗜热细菌繁殖时产生高达到70℃以上的热，经过1～2个月可将病毒、细菌、寄生虫卵等病原体杀死。但此法不适用于炭疽、气肿疽等芽孢病原体引起的疫病，这类疫病的粪便应焚烧或深埋。
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